Programowanie modułu MEGA 2560 jest w kompilatorze BASCOM bardzo proste. W modułe zastosowano mikrokontroler ATMega2560. W kompilatorze BASCOM należy wybrać [CHIP] m2560def.dat
W zakładce [Communication] wybieramy [Frequency] - 16000000 Hz
i kompilujemy napisany program.

Następnie:
 - wybieramy [Programmer- ARDUINO STK500V2]
   (Atmel STK500V2/Arduino protocol compatible Programmer),
 - należy sprawdzić, w którym porcie COM został zainstalowany
   konwerter (CH340) i ten port ustawiamy w [Options->Programmer],
 - ustawiamy BAUD - 115200, Timeout - 100 i (lub nie) Auto Flash.

Programowanie modułu MEGA 2560 w trybie AUTO MODE
(ustawiono Auto Flash)
Po uruchomieniu programatora [F4] cały proces programowania przebiega  automatycznie.

Programowanie modułu MEGA 2560 w trybie MANUAL MODE
Jeżeli nie zostało ustawione Auto Flash, to w trybie manualnym należy:
 - zidentyfikować układ [Chip->Identify],
 - załadować plik *.bin do bufora - [Buffer->Load from file],
 - wyczyścić pamięć FLASH mikrokontrolera [Erase chip],
 - zaprogramować mikrokontroler - [Write buffer to chip].